Размером около 2-3 мм, очень быстрые, летают. На растениях появилось вот такое (подозреваю что из-за
них) :

Добрый день! Мошки - это вероятно сциариды. Они появляются от переувлажнения почвы, в которой к тому же слишком много органики. Повреждений растений, в том числе таких, как на Ваших фото, от сциарид быть не может. Зато такие повреждения могут давать разнообразные грибки (болезнь - грибковое поражение). А вот они ТОЖЕ от неправильной почвы с неправильным поливом.
Чтобы пропали сциариды нужно просушить земляной ком - они исчезнут сами. Проблема не в них. Грибок сам не исчезнет. От него нужно обработать коронетом, тилтом, другим доступным противогрибковым средством. Почитайте также про правильную почву и режим полива. И обработать нужно все растения, без исключений. Не только те, где Вы что-то уже видите.

Спасибо)